Жесткая вода содержит высокие концентрации кальция, магния и других минеральных солей, которые при нагревании и испарении могут образовывать отложения накипи на поверхностях теплообменников водоохлаждаемого конденсатора. Со временем эта накипь действует как изолирующий барьер между охлаждающей водой и металлическими поверхностями конденсатора, что снижает эффективность теплообмена. По мере утолщения накипи для достижения того же эффекта охлаждения требуется больше энергии, что приводит к снижению эффективности системы, увеличению эксплуатационных расходов и увеличению износа системы. Накопление накипи также может привести к снижению пропускной способности внутри конденсатора, что приведет к повышению давления и температуры. Для борьбы с этими эффектами во многих конденсаторах с водяным охлаждением используются умягчители воды, удаляющие ионы кальция и магния, или химические вещества, препятствующие образованию накипи.

Качество воды с экстремальным уровнем pH (слишком кислое или слишком щелочное) может привести к коррозии металлических компонентов в конденсатор с водяным охлаждением . Вода с низким pH (кислая) может вызвать окисление металлических поверхностей, что приводит к ржавчине и ослаблению структурной целостности конденсатора, тогда как вода с высоким pH (щелочная) может вызвать щелочную коррозию, которая разрушает металлические поверхности. Присутствие хлоридов, часто встречающихся в морской или промышленной охлаждающей воде, может ускорить точечную коррозию, приводящую к локальным повреждениям. Чтобы предотвратить коррозию, воду следует обрабатывать для поддержания оптимального диапазона pH, обычно от 7 до 8,5, что идеально подходит для предотвращения как кислотной, так и щелочной коррозии. Ингибиторы коррозии, такие как фосфаты, соединения цинка или силикаты, обычно используются в сочетании с регулярными испытаниями воды, чтобы гарантировать, что качество воды находится в допустимых пределах.

Источники воды, содержащие отложения, грязь или другие твердые частицы, могут привести к засорению и закупорке трубопроводов и систем теплообменников конденсатора с водяным охлаждением. Эти твердые частицы могут препятствовать потоку воды, снижая ее способность отводить тепло от конденсатора. Уменьшенный поток увеличивает давление внутри конденсатора и снижает его общую эффективность охлаждения. Со временем накопление отложений может привести к абразивному износу внутренних компонентов, что еще больше увеличивает потребность в техническом обслуживании и увеличивает вероятность отказа. Чтобы смягчить эти проблемы, в точках входа воды обычно устанавливаются системы фильтрации или сетчатые фильтры, чтобы улавливать крупные частицы перед тем, как они попадут в конденсатор. Эти системы предназначены для удаления песка, ила и других взвешенных твердых частиц, которые могут повредить внутренние компоненты или снизить производительность.

Биологическое обрастание происходит, когда микроорганизмы, такие как бактерии, водоросли и грибки, скапливаются на теплообменных поверхностях конденсатора. Если их не контролировать, эти микроорганизмы могут образовывать биопленку, которая действует как изолирующий слой и значительно ухудшает теплообмен. Биопленка также способствует коррозии и засорению, еще больше снижая эффективность системы. Биологическое обрастание чаще встречается в системах, использующих поверхностные воды (реки, озера или морская вода), которые имеют более высокий уровень органического материала. Рост водорослей особенно проблематичен, поскольку он может блокировать поток воды и приводить к увеличению энергопотребления, поскольку система компенсирует снижение эффективности теплопередачи. Для борьбы с биообрастанием системы очистки воды часто включают химические биоциды (такие как хлор, бром или соединения на основе меди), которые убивают микроорганизмы до того, как они смогут образовать биопленку. Обработка ультрафиолетом (УФ) — еще один экологически чистый вариант предотвращения роста микробов.